學校現有附屬醫院6所(綜合性醫院4所，兒童醫院、口腔醫院各1所)。在《中國最佳醫院綜合排行榜》(全國100所)中，附屬兒童醫院、附屬第一醫院、附屬第二醫院分別排名第57位、第73位、第81位。各附屬醫院共擁有國家臨床重點專科28個。醫院編制床位10600余張，年門診量逾800萬人次，年收治住院病人30萬人次。另有2所附屬醫院正在建設階段。此外，有18所非直屬附屬醫院和30多所教學醫院分布在重慶、四川及深圳等地。

學校堅持自主創新，科學研究能力和水不斷提升，“十二五”以來，牽頭承擔國家科技重大專項、國家重大科研儀器研制專項、國家重大科學研究計劃項目、國家重點基礎研究發展計劃(973計劃)項目、國家高技術發展研究計劃(863計劃)項目、國家科技計劃支撐項目、教育部新世紀優秀人才項目、國家自然科學基金項目670余項。獲各類科技成果獎勵110余項，其中重慶市科學技術獎、何梁何利獎等省部級以上獎勵40余項。學校獨立研制的高強度聚焦超聲腫瘤治療系統(海扶刀)屬世界首創，是我國第一臺具有完全自主知識產權的大型醫療設備，量產后獲得國內外業界廣泛認可。

學校積極開展國內外交流合作，年來與美國、英國、法國、日本、加拿大、澳大利亞、比利時、瑞典、新西蘭、韓國、馬來西亞等10多個國家或地區的20余所高水大學開展研究生、七年制和本專科生聯合培養，以及科學研究合作。與復旦大學、華中科技大學、西南大學等“985工程”大學聯合培養長學制醫學生。

建校60年來，學校在人才培養、科學研究和醫療服務等方面取得突出成績，為我國的醫學教育和衛生事業發展，以及服務地方經濟建設作出了重要貢獻。今天，全體重醫人團結拼搏、銳意進取、開拓創新，正在為建設學科優勢突出、辦學鮮明、國際化、開放型的高水醫科大學而努力奮斗!

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