中醫基礎理論是中醫學下設的二級學科，是中醫認識人體結構、生理功能、病理現象和進行診斷、防治疾病的基本理論。它是指導中醫各學科（包括中藥、針灸以及臨床各科等）的理論基礎。中醫學不是純經驗性的醫學，它有著一套獨特的理論體系。其理論體系是在長期的醫療實踐中，在古代哲學影響和指導下并融入了當時自然科學知識而逐漸形成和發展起來的。

全國共有20所招收中醫基礎理論專業研究生的學校參與了排名，其中排名的是北京中醫藥大學，排名第二的是廣州中醫藥大學，排名第三的是山東中醫藥大學，以下是中醫基礎理論專業考研學校排名具體名單：