學校現有番禺、越秀兩個校區，占地面積37.23萬方米，建筑面積48.65萬方米。下設22個學院，14所附屬醫院，28個研究機構。擁有1個國家醫學中心，1個國家臨床醫學研究中心，1個國家重點實驗室，11個省部級重點實驗室，3個省部級工程技術研究中心/工程實驗室，3個省部級協同創新中心、1個國家大學科技園培育基地、32個市（廳）級重點實驗室。擁有1個國家重點學科，7個省部級重點學科，32個市（廳）級重點學科；臨床醫學入選國家“雙一流”建設學科；臨床醫學、藥理學與毒理學、分子生物學與遺傳學、生物學與生物化學、免疫學、神經科學與行為學、微生物學進入ESI排名全球前1%，全學科ESI綜合排名位居全國高校百強。學校擁有19個國家臨床重點專科，80個省（部）級重點專科，其中呼吸內科排名全國第一、變態反應科排名全國第二、胸外科排名全國第四、小兒外科排名全國第四、小兒內科排名全國第六、精神醫學專科排名全國第七。