牡丹江醫學院創建于1958年，著名史學家郭沫若先生題寫了校名。是黑龍江省東南部地區唯一一所省屬全日制普通本科醫藥院校。1997年一次性通過原國家教委合格評估。2005年經黑龍江省學位委員會批準為新增碩士學位立項建設單位。2006年在國家本科教學水評估中專家組給予了優秀的評價。

學院現有教職工2300人，具有副高級以上職稱550人。專任教師496人，博士62人，其中留學歸國博士6人，碩士288人，碩士以上學歷人員占專任教師的62%。有兼職博士研究生導師3人、碩士研究生導師30人。有11人擔任國家級學會理事，13人擔任省級學會副理事長，77人擔任省級學會理事等學術職務。

學院占地面積72.5萬方米，建筑面積30.9萬方米，圖書館藏書100多萬冊，中外文期刊2257種，校園網絡系統先進，擁有各類網上教學資源3126部。教學科研儀器設備總值1.7億元，固定資產總值6億元。《牡丹江醫學院學報》在全國公開發行。

學院有8所附屬醫院，總床位數6080張。其中直屬附屬醫院2所，床位2000張。附屬紅旗醫院是具有1200張床位的“全國百姓放心醫院”、“全國示范醫院”，是黑龍江省東南部地區具有明顯優勢的三級甲等醫院。

學院面向全國25個省（市）、自治區招收本科生，現有全日制在校本、專科學生9490人。開設臨床醫學、醫學影像學、麻醉學、醫學檢驗學、護理學、康復治療學、口腔醫學、藥學、制藥工程、藥物制劑、預防醫學、信息管理與信息系統、公共事業管理、應用心理學、市場營銷15個本科專業。其中醫學影像學、麻醉學、醫學檢驗專業是省級重點專業，醫學影像學專業是省級一類專業和國家級一類建設專業。人體解剖學、組織胚胎學、生物遺傳學、病原生物學、影像設備學、診斷學是省級精品課程，內科學、機能學實驗是省高校教學團隊。

人體解剖與組織胚胎學、病理學與病理生理學、藥理學是省級重點學科。“抗纖維化生物治療”實驗室是黑龍江省重點實驗室，“麻醉與危重病學”實驗室是與哈爾濱醫科大學協作的黑龍江省重點實驗室，“組織損傷與修復”實驗室是黑龍江省高校重點實驗室。“生物化學與分子生物學實驗室”、“生物學實驗室”、“藥學實驗室”是中央與地方共建高校基礎實驗室。學院設有黑龍江省教育廳批準成立的“校企共建工程技術研發中心”和與牡丹江市合作的“牡丹江市北藥開發基地”。

人體解剖與組織胚胎學、病理學與病理生理學、生理學、生物化學與分子生物學、內科學、影像醫學與核醫學、藥理學等學科于1997年開始與佳木斯大學、黑龍江中醫藥大學聯合培養碩士研究生324人，已取得碩士學位人員123人。

幾年，學院共獲得各級科研立項270項，其中承擔與合作的國家自然科學基金項目，國家863、973以及國家科技攻關項目共計27項，主持省自然科學基金項目38項，獲得黑龍江省教育廳等廳局級項目205項。獲得黑龍江省高校科學技術獎33項，獲得牡丹江市科學技術獎58項。獲得國家發明專利和使用新型專利7項。發表論文2527篇，其中有44篇被SCI等國際三大檢索收錄，出版專著、譯著159部，主編、參編教育部、衛生部規劃教材41部。

學院和俄羅斯海參崴國立醫科大學、吉爾吉斯斯坦醫科大學、韓國首爾大學醫學院、韓國仁川醫科大學以及日本金澤醫科大學及菲律賓法蒂瑪大學等建立了交流與合作關系。

學院始終把教育教學放在中心地位，強化素質教育，注重學生實踐能力、動手能力、思維能力的培養，學生綜合素質和適應能力不斷增強，受到用人單位的歡迎，得到了社會的廣泛認可。

學院遵循發展是第一要義的科學發展觀，堅持“為農村辦學、為基層服務”，把建設和實現小康社會作為辦學的責任。曾受到書記處、國家教育部、國家衛生部的高度評價，1989年榮獲國家優秀教學成果特等獎。

建校以來，培養各級各類醫學、藥學畢業生26000余人，為黑龍江省和國家醫療衛生事業輸送了合格的人才。

目前，全院教職工秉承“立德立行、唯實唯新”的校訓，發揚“執著、愛校、求實、合作、創新、奉獻”的牡醫精神，為學院實現跨越式發展堅持不懈，共同奮斗！