學校的人才培養涵蓋了本科生教育、研究生教育、留學生教育、繼續教育及干部培訓等各層次，建有“國家大學生文化素質教育基地”、“國家理科基礎科學研究與教學人才培養基地”、“國家生命科學與技術人才培養基地”和植物生產、動物科學類、農業生物學虛擬仿真國家級實驗教學中心，是首批通過全國高校本科教學工作優秀評價的大學之一，2000年獲教育部批準建立研究生院，首批入選了國家卓越農林人才培養計劃。

學校擁有作物學、農業資源與環境、植物保護和獸醫學等4個一級學科國家重點學科，蔬菜學、農業經濟管理和土地資源管理等3個二級學科國家重點學科，及食品科學國家重點培育學科。第四輪全國一級學科評估結果中，作物學、農業資源與環境、植物保護、農林經濟管理4個學科獲評A+，公共管理、食品科學與工程、園藝學3個學科獲評A類。有8個學科進入江蘇高校優勢學科建設工程。農業科學、植物與動物學、環境生態學、生物與生物化學、工程學、微生物學、分子生物與遺傳學等7個學科領域進入ESI學科排名全球前1%，其中農業科學和植物與動物科學已經進入前1‰，躋身世界頂尖學科行列。

學校建有作物遺傳與種質創新國家重點實驗室、國家肉品質量安全控制工程技術研究中心、國家信息農業工程技術中心、國家大豆改良中心、國家有機類肥料工程技術研究中心、農村土地資源利用與整治國家地方聯合工程研究中心、綠色農藥創制與應用技術國家地方聯合工程研究中心等66個國家及部省級科研臺。“十二五”以來，學校科研經費超26億元，獲得國家及部省級科技成果獎100余項，其中作為第一完成單位獲得國家科學技術獎8項。學校憑借雄厚的科研實力，主動服務社會、服務“三農”，創造了巨大的經濟社會效益，多次被評為國家科教興農先進單位。

學校國際交流日趨活躍，國際化程度不斷提高，先后與30多個國家和地區的150多所境外高水大學、研究機構保持著學生聯合培養、學術交流和科研合作關系。與美國加州大學戴維斯分校、英國雷丁大學、澳大利亞西澳大學、新西蘭梅西大學等世界知名高校開展了“交流訪學”、“本科雙學位”、“本碩雙學位”等數十個學生聯合培養項目。學校建有“中美食品安全與質量聯合研究中心”、“南京農業大學--康奈爾大學國際技術轉移中心”、“豬鏈球菌病診斷國際參考實驗室”等多個國際合作臺。2007年成為教育部“接受中國政府獎學金來華留學生院校”。2008年成為全國首批“教育援外基地”。2012年獲批建設全球首個農業孔子學院。學校倡議發起設立了“世界農業獎”，并連續4屆分別向來自康奈爾大學、波恩大學、加州大學戴維斯分校、阿爾伯塔大學的獲獎者頒發獎項。，與美國加州大學戴維斯分校（UC Davis）簽署協議共建“全球健康聯合研究中心”（One Health Center)，獲科技部批準援建“中-肯作物分子生物學聯合實驗室”，獲外交部、教育部聯合批準成立“中國-東盟教育培訓中心”。

學校校區總面積9方公里，建筑面積74萬方米，資產總值35億元。圖書資料收藏量235萬冊（部），擁有外文期刊1萬余種和中文電子圖書500余萬種。學校教學科研和生活設施配套齊全，校園環境優美。

在百余年辦學歷程中，學校秉承以“誠樸勤仁”的南農精神，始終堅持“育人為本、德育為先、弘揚學術、服務社會”的辦學理念，先后培養造就了包括54位院士在內的20余萬名優秀人才。

展望未來，作為現代中國高等農業教育的拓荒者，南京農業大學將以人才強校為根本、學科建設為主線、教育質量為生命、科技創新為動力、服務社會為己任、文化傳承為使命，朝著世界一流農業大學目標邁進！