復旦大學上海醫(yī)學院（原上海醫(yī)科大學）創(chuàng)建于1927年，創(chuàng)立時名為國立第四中山大學醫(yī)學院，是中國創(chuàng)辦的第一所國立大學醫(yī)學院，顏福慶出任首任院長。1932年，獨立為國立上海醫(yī)學院，為當時中國唯一的國立醫(yī)學院。1939年，因抗戰(zhàn)爆發(fā)內遷至云南昆明。1940年，輾轉遷至四川重慶。1946年，抗戰(zhàn)勝利，遷回上海。1952年，更名為“上海第一醫(yī)學院”。1959年，被定為全國16所重點高等學府之一。1985年，更名為“上海醫(yī)科大學”。2000年，上海醫(yī)科大學和復旦大學合并辦學，組建成為新的復旦大學。2011年，新的上海醫(yī)學院成立，作為復旦大學黨政的派出機構，根據(jù)學校的授權，在大醫(yī)口的人才培養(yǎng)、科學研究、學科建設、發(fā)展規(guī)劃、資源配置、對外交流等方面，行使相對獨立的管理權限。

現(xiàn)有直屬院系所8個，附屬醫(yī)院16所（其中直屬醫(yī)院6所，非直屬醫(yī)院10所）。設有本科專業(yè)9個：臨床醫(yī)學（八年制）、臨床醫(yī)學（五年制）、臨床醫(yī)學（六年制）、基礎醫(yī)學、法醫(yī)學、預防醫(yī)學、公共事業(yè)管理、藥學、藥學（臨床藥學方向）、護理學，高職專業(yè)1個：護理。有博士學位授予權的一級學科9個（醫(yī)學門類6個，非醫(yī)學門類3個），設有博士后科研流動站8個：生物學、基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學、中西醫(yī)結合、藥學、公共管理（醫(yī)）、護理學。 現(xiàn)有博士研究生1892人（含港澳臺3人，留學生11人），碩士研究生2365人（含港澳臺25人，留學生48人），普通本科生3056人（含港澳臺64人，留學生179人），專科生702人，共計8015人。有專任教師445人、專職科研人員97人，其中高級職稱435人。有中國科學院院士4人（楊雄里、沈自尹、王正敏、葛均波），中國工程院院士5人（湯釗猷、陳灝珠、顧玉東、聞玉梅、周良輔），教育部“獎勵計劃”特聘教授23名，講座教授7名，“國家重點基礎研究發(fā)展計劃（含重大科學研究計劃）”項目首席科學家17人，國家杰出青年基金獲得者26人，國家自然科學基金優(yōu)秀青年基金7人。

有國家一級重點學科3個：生物學、基礎醫(yī)學、中西醫(yī)結合。有國家二級重點學科12個：內科學（心血管病、腎病、傳染病）、兒科學、神經(jīng)病學、影像醫(yī)學與核醫(yī)學、外科學、眼科學、眼耳鼻喉科學、腫瘤學、婦產(chǎn)科學、流行病學與衛(wèi)生統(tǒng)計學、藥劑學、社會醫(yī)學與衛(wèi)生事業(yè)管理；有國家重點實驗室1個：醫(yī)學神經(jīng)生物學，教育部重點實驗室5個：醫(yī)學分子病毒學、代謝分子醫(yī)學、智能化遞藥、公共衛(wèi)生安全、癌變與侵襲原理，衛(wèi)生部重點實驗室9個：糖復合物、抗生素臨床藥理、手功能重建、衛(wèi)生技術評估、醫(yī)學分子病毒學、聽覺醫(yī)學、視眼研究、病毒性心臟病、新生兒疾病，上海市重點實驗室8個：周圍神經(jīng)顯微外科、醫(yī)學圖像處理與計算機輔助技術、器官移植、女性生殖內分泌相關疾病、視覺損害與重建、乳腺腫瘤、出生缺陷防治、老年醫(yī)學臨床。

上海醫(yī)學院全面進入校區(qū)改擴建工程建設階段，已啟動一號醫(yī)學科研樓、二號醫(yī)學科研樓、學生書院、醫(yī)科圖書館、綜合游泳館、地下停車庫的樓宇建設。現(xiàn)有附屬醫(yī)院16所，其中直屬醫(yī)院6所，分別是復旦大學附屬中山醫(yī)院、復旦大學附屬華山醫(yī)院、復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院、復旦大學附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院、復旦大學附屬兒科醫(yī)院、復旦大學附屬眼耳鼻喉科醫(yī)院。非直屬醫(yī)院10所，分別是復旦大學附屬金山醫(yī)院、復旦大學附屬上海市第五人民醫(yī)院、上海市（復旦大學附屬）公共衛(wèi)生臨床中心、復旦大學附屬華東醫(yī)院、復旦大學附屬浦東醫(yī)院、復旦大學附屬精神衛(wèi)生中心（籌）、復旦大學附屬青浦區(qū)中心醫(yī)院（籌）、復旦大學附屬靜安區(qū)中心醫(yī)院（籌）、復旦大學附屬閔行區(qū)中心醫(yī)院（籌）、復旦大學附屬口腔醫(yī)院（籌）。