21項(xiàng)，其中，國(guó)家“973計(jì)劃”項(xiàng)目、“863計(jì)劃”項(xiàng)目、國(guó)家重大專項(xiàng)、國(guó)家科技支撐計(jì)劃、行業(yè)專項(xiàng)、國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目等國(guó)家級(jí)課題122項(xiàng)，（其中“973”牽頭項(xiàng)目1項(xiàng)，“973”課題6項(xiàng)，“863”課題1項(xiàng)，國(guó)家重大科技專項(xiàng)牽頭5項(xiàng)，國(guó)家科技支撐計(jì)劃課題11項(xiàng)，行業(yè)專項(xiàng)3項(xiàng)，國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目57項(xiàng)）；獲各級(jí)各類科技進(jìn)步獎(jiǎng)37項(xiàng)，其中，部省級(jí)一、二等獎(jiǎng)18項(xiàng)，申請(qǐng)國(guó)家專利73項(xiàng)；到位科研經(jīng)費(fèi)過(guò)億元，技術(shù)合作或轉(zhuǎn)讓合同經(jīng)費(fèi)5千多萬(wàn)元。
學(xué)校1994年發(fā)起組建的高科技股份制公司“華神藥業(yè)股份有限公司”是中醫(yī)藥院校參與發(fā)起的第一家上市公司。2002年，學(xué)校參與發(fā)起成立國(guó)家中藥現(xiàn)代化產(chǎn)業(yè)基地（四川），并承擔(dān)了四川省33個(gè)GAP基地中17個(gè)基地的建設(shè)指導(dǎo)工作。2002年以來(lái)，學(xué)校先后承辦了由國(guó)家科技部等三部?jī)删謨稍汉退拇ㄊ∪嗣裾�府共同主辦的第一、第二屆中醫(yī)藥現(xiàn)代化國(guó)際科技大會(huì)的學(xué)術(shù)組織工作，目前正在承辦的第三屆中醫(yī)藥現(xiàn)代國(guó)際科技大會(huì)的學(xué)術(shù)組織工作。
學(xué)校是教育部最早確定的有條件接受外國(guó)留學(xué)生的200所高校之一，也是最早開(kāi)展對(duì)港澳臺(tái)教育的中醫(yī)藥院校之一。學(xué)校自上世紀(jì)八十年以來(lái)接收和培養(yǎng)了來(lái)自韓國(guó)、日本、新加坡、以色列、德國(guó)、美國(guó)、法國(guó)、捷克及香港、澳門(mén)、臺(tái)灣等29個(gè)國(guó)家和地區(qū)的學(xué)歷學(xué)生（包含本科、碩、博士研究生）及多種類型的中醫(yī)藥、針灸短期進(jìn)修培訓(xùn)學(xué)員4300余人次，培養(yǎng)了我國(guó)第一位外籍針灸學(xué)博士和方劑學(xué)博士。學(xué)校與美國(guó)、葡萄牙、德國(guó)、日本、以色列、新加坡、韓國(guó)、香港、臺(tái)灣、澳門(mén)等22個(gè)國(guó)家和地區(qū)的大學(xué)、醫(yī)療、科研機(jī)構(gòu)及學(xué)術(shù)團(tuán)體建立了交流合作關(guān)系。經(jīng)教育部批準(zhǔn)同意，我校在葡萄牙舉辦了中醫(yī)針灸本科學(xué)歷教育分校，是我國(guó)第一個(gè)在海外舉辦中醫(yī)藥高等學(xué)歷教育的高校。學(xué)校與英國(guó)牛津大學(xué)、倫敦城市大學(xué)開(kāi)展了本科、研究生合作培養(yǎng)項(xiàng)目，與臺(tái)灣義守大學(xué)等高校開(kāi)展了互換生（互相交換學(xué)生學(xué)習(xí)）校際交流項(xiàng)目，每年選派一批學(xué)生到項(xiàng)目合作高校交流學(xué)習(xí)。我校是科技部授予的“中醫(yī)藥國(guó)際科技合作基地”，國(guó)家中醫(yī)藥管理局授予的“中醫(yī)藥國(guó)際交流合作教育基地和醫(yī)療基地”，世界衛(wèi)生組織也在我校設(shè)立了“WHO合作中心”。