新疆大學科學技術學院成立于2002年8月。2004年1月，通過教育部關于辦學資質的審核，成為我國首批本科院校舉辦的獨立學院。2012年5月,通過自治區學位委員會、自治區教育廳審核,學院取得學士學位授予權資格。6月，自治區人民政府決定新疆大學與阿克蘇地區合作辦學,由阿克蘇地區負責完成校園基本建設，校園建成后，將新疆大學科學技術學院搬遷至阿克蘇辦學，由新疆大學負責教學和管理。條件成熟、申請教育部評估合格后轉制為公辦二本院校。

新疆大學科學技術學院現校址為新疆烏魯木齊市西北路499號，搬遷后為阿克蘇地區溫宿縣新城區學府路1號。阿克蘇校區校園占地面積2856畝，分三期建設，其中一期占地面積1700畝，建筑面積30萬方米，共投入建設資金15億元，規劃在校生6000-8000人；二期規劃建筑面積21.7萬方米，遠期規劃建筑面積17萬方米；遠期規劃在校生15000人。

新疆大學科學技術學院交通便利、環境幽雅、人文薈萃。學院擁有專兼任教師257名（專任教師均為碩士及以上學歷）其中教授23人，副教授79人，具有博士學位教師72人，碩士學位教師182人。現有18個本科專業，覆蓋工學、文學、經濟學、管理學、法學等五大學科門類。在校本科5500余人，是一所面向全國統一招生的綜合性全日制應用型本科大學。

新疆大學科學技術學院地處“塞外江南”、“中國紅富士蘋果之鄉”的阿克蘇，交通便利，環境幽雅，人文薈萃。學院校園環境優美，教學和生活設施齊全。學院大力加強校園內涵建設，投入3000余萬元建設智慧化校園；1600萬元配置新的教學和實驗實訓設備儀器；1043萬元配置圖書及信息資料，教學方面有現代化教學電腦機房、語音室、多媒體教室、先進實驗室、實訓基地等設施；大學生活方面有圖書館、禮堂、交流中心、風雨操場、體育館、食堂、學生連體宿舍公寓、教職工公寓等設施。新疆大學科學技術學院搬遷后校址位于阿克蘇地區溫宿縣新城區學府路1號，校園占地面積2856畝，規劃建筑面積68.7萬方米，分三期建設，其中一期占地面積1700畝，建筑面積30萬方米，共投入建設資金15億元，規劃在校生6000-8000人（一期工程由清華大學建筑設計研究院規劃設計，其中圖書館、體育館、學術交流中心等建筑風格別具一格），二期規劃建筑面積21.7萬方米，遠期規劃建筑面積17萬方米，遠期規劃在校生15000人。學院是以工學、經濟學為主，管理學、文學、法學等各學科協調發展的綜合應用型現代化本科院校，面向全國招生。

三高標準：高起點、高標準、高質量。阿克蘇地委、行署提出校園基本建設和教學基礎能力建設創全國“一流規劃設計，一流質量標準，一流建設速度”，教學內涵建設按照創全疆“一流辦學理念，一流師資隊伍，一流教學質量”的要求。

資源雄厚：根據中央新疆工作會議精神，教育強省浙江對口援建。新疆大學科學技術學院與浙江工業大學、杭州電子科技大學、浙江財經大學、浙江工商大學等四所大學建立對口援建關系，部分專業課程由浙江高校教師授課，采取浙江每所高校包建4-5個專業的形式，打造一批知名品牌專業。教學管理由新疆大學負責，部分專業由新疆大學選派教師授課。

公辦本科：新疆大學科學技術學院阿克蘇校區是新疆大學科學技術學院與阿克蘇地區合作建設的院校，由阿克蘇行政公署全額投資完成校園基本建設，根據合作協議，阿克蘇校區辦學條件成熟后，申請教育部評估合格后轉制為公辦二本院校。

新疆大學科學技術學院堅持從嚴治教，狠抓學風建設，致力于培養應用型、技能型高素質人才。在穩步提升教學質量的同時，加強社會實踐，開展豐富多彩、健康向上的校園科技文化活動，活動內容涵蓋學術報告類、經驗交流類、知識競賽類、文藝演出類、體育競賽類、文化宣傳類、語言競技類等20余項，并鼓勵學生廣泛參加各類學科競賽，全面提高大學生的綜合素質。年來，學院學生在大學生英語競賽、大學生基礎力學實驗競賽、大學生會計信息化技能大賽、大學生數學建模大賽等各類全國大賽中獲獎，其中獲國家級獎項64個、省部級獎項93個