云南農業大學農學與生物技術學院

生物技術、農學、種子科學與工程、中藥資源與開發、中草藥栽培與鑒定、智慧農業

云南農業大學動物科學技術學院

動物科學、蜂學、水產養殖學、草業科學

云南農業大學動物醫學院

動物醫學、獸醫公共衛生、動物醫學（第二學士學位）

云南農業大學植物保護學院

植物保護、動植物檢疫、森林保護

云南農業大學園林園藝學院

風景園林、園藝、設施農業科學與工程、園林、環境設計

云南農業大學資源與環境學院

生態學、環境科學與工程、農業資源與環境、土地資源管理

云南農業大學食品科學技術學院

食品科學與工程、食品質量與安全、葡萄與葡萄酒工程

云南農業大學煙草學院

香料香精技術與工程、煙草

云南農業大學龍潤普洱茶學院

茶學

云南農業大學水利學院

土木工程、土木工程（卓越工程師班）、水利水電工程、水利水電工程（卓越工程師班）、水文與水資源工程、水務工程、農業水利工程、土地整治工程

云南農業大學機電工程學院

機械設計制造及其自動化、機械電子工程、車輛工程、能源與動力工程、電氣工程及其自動化、農業機械化及其自動化

云南農業大學理學院

數學與應用數學、應用化學、化學生物學、電子信息工程、生物工程

云南農業大學大數據學院（信息工程學院）

計算機科學與技術、數據科學與大數據技術、人工智能

云南農業大學建筑工程學院

土木工程、建筑環境與能源應用工程、給排水科學工程、農業建筑環境與能源工程、建筑學、城鄉規劃、工程管理、工程造價

云南農業大學經濟管理學院

經濟學、投資學、農林經濟管理、農村區域發展、電子商務

云南農業大學人文社會科學學院

社會工作、秘書學、旅游管理、酒店管理

云南農業大學外語學院

英語、泰語、越南語、翻譯

云南農業大學體育學院

體育教育、體育教育（校園足球人才）、社會體育指導與管理

云南農業大學國際學院（中國-東盟教育培訓中心）

土木工程（土木與環境工程）（中外合作辦學）、農林經濟管理（中外合作辦學）

云南農業大學熱帶作物學院

秘書學（高職本科）、食品科學與工程（高職本科）、風景園林（高職本科）、農學（高職本科）、林學（高職本科）、中草藥栽培與鑒定（高職本科）、農林經濟管理（高職本科）、電子商務（高職本科）、作物生產與經營管理（專科）、茶葉生產與加工技術（專科）、中草藥栽培與加工技術（專科）、現代農業經濟管理（專科）、休閑農業經營與管理（專科）、林業技術（專科）、森林生態旅游與康養（專科）、畜牧獸醫（專科）、建筑設計（專科）、園林工程技術（專科）、建設工程管理（專科）、工程造價（專科）、食品檢驗檢測技術（專科）、計算機網絡技術（專科）、大數據與會計（專科）、大數據與會計（新西蘭交流項目）（專科）、國際經濟與貿易（新西蘭交流項目）（專科）、酒店管理與數字化運營（專科）、現代文秘（專科）