事業單位的經費形式一般分為三種：一是財政撥款，即全額撥款，或稱財政性資金基本保障；二是財政補助，即差額補貼，或稱財政性資金定項或定額補助；三是自收自支，即經費自理，或稱財政性資金零補助。其中：財政補助（即差額補貼）是指事業單位從同級財政部門取得的各類財政撥款，包括正常經費和專項資金。在我國傳統的預算體制和行政事業單位預算會計制度下，該資金也稱為經費，收到的該筆資金稱為撥入經費。

按現行體制，我市對差額事業單位的補助為基本工資的60%部分，在職人員醫療保險的60%部分，離、退休人員離、退休費的100%部分（其中地方津貼“75元、人。月”財政承擔50%），離、退休人員醫保經費的100%部分（其中計算基數中地方津貼“75元、人。月”財政承擔50%）。
剩余40%部分的基本工資、住房公積金、單位公用經費由事業單位從單位征收的行政事業性收費和非營利性（例如公立醫院等）經營收入中補充。
差額事業單位的工資構成也是由崗位工資、薪級工資和事業單位績效工資構成，其中：崗位工資和薪級工資由財政承擔60%部分，剩余的基本工資40%部分和績效工資由單位組織收入的行政事業性收費和經營收入承擔。從工資總額來看，全額事業單位與差額事業單位工資總量是一致的。
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