學校堅持以人才培養為根本，以提高質量，加強教學基本建設，深化教育教學改革，大力促進人才培養質量不斷提高，辦學優勢不斷凸顯。專業設置從單一的醫科類3個專業發展到醫、理、工、管、文5個學科門類的28個本科專業，其中國家級專業5個、浙江省重點專業8個、浙江省“十二五”優勢專業6個，中醫學入選首批國家級專業綜合改革試點項目。擁有國家教學團隊1支、浙江省教學團隊5支，浙江省教學名師7人，國家精品課程4門、國家精品資源共享課4門、國家精品視頻公開課1門、浙江省精品課程25門。國家實驗教學示范中心1個、省級實驗教學示范中心5個。在三次教學成果獎評選中，獲得國家級教學成果二等獎2項，省級教學成果一等獎4項。2001年學校在教育部首批本科教學工作隨機性水評估中獲得優秀，并被教育部評估專家譽為“開創了我國中醫高等教育的新模式”。2008年再次獲得教育部本科教學工作水評估優秀。2010年中醫學專業、2013年臨床醫學專業、中藥學專業通過國家試點認證。